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Table of Contents
MouseBIRN Schedule
This document lists the major tasks, the organizations responsible for leading the efforts, and the timeline for the MouseBIRN project. The principle point of contacts are given for each organization.
Phases of Development
- May 2008 - Oct 2008 : MBAT Core re-engineer and development
- Nov 2008 - May 2009 : MBAT Core Advanced Feature development / Client Plugin development
- May 2009 - May 2010 : Advanced Client Plugin development
Key Milestones
- Sep 30, 2008: Code Freeze
- Oct 20, 2008: MBAT3.0 Beta Release @ BIRN All Hands Meeting
- April/May 2009: MouseBIRN AHM
Timeline
| Legend | |
| Major Task | |
| SubTask | |
| Tentative Task | |
| Task | Group | 2008 | 2009 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| J | J | A | S | O | N | D | J | F | M | A | M | J | J | A | S | O | N | D | ||
| AIDB | CCDB (MaryAnn) BirnCC (Jeff G) | |||||||||||||||||||
| Schema Design | ||||||||||||||||||||
| Upload Webpage | ||||||||||||||||||||
| MBAT datasource plugin | ||||||||||||||||||||
| Uniform WebServices API | UCSD (Ilya) | TBD | ||||||||||||||||||
| Gene Expression API | ||||||||||||||||||||
| Image2D API | ||||||||||||||||||||
| Uniform WebServices MBAT plugins | ||||||||||||||||||||
| MBAT | LONI (Daren) | |||||||||||||||||||
| Plugin Architecture | ||||||||||||||||||||
| Re-engineer MBAT Framework | ||||||||||||||||||||
| Evaluate ImageJ File I/O plugins | ||||||||||||||||||||
| Evaluate ImageJ processing plugins | ||||||||||||||||||||
| Design MBAT framework | ||||||||||||||||||||
| Registration Core | ||||||||||||||||||||
| Complete API implementation | ||||||||||||||||||||
| Document API on wiki | ||||||||||||||||||||
| DocManager Core | ||||||||||||||||||||
| ImageJ File I/O Plugins | ||||||||||||||||||||
| Search Core | ||||||||||||||||||||
| DataSource plugin framework | ||||||||||||||||||||
| Keyword search framework | ||||||||||||||||||||
| Migrate existing clients to plugins | ||||||||||||||||||||
| DataSource plugin documentation | ||||||||||||||||||||
| RDF search | ||||||||||||||||||||
| Viewer Core | ||||||||||||||||||||
| Viewer plugin framework | ||||||||||||||||||||
| 3 planar view | ||||||||||||||||||||
| Dynamic labels | ||||||||||||||||||||
| Interactive labels | ||||||||||||||||||||
| Object selection | ||||||||||||||||||||
| Arbitrary slice plane | ||||||||||||||||||||
| Volume Rendering | ||||||||||||||||||||
| 3D surfaces | ||||||||||||||||||||
| Multiple atlases simultaneously | ||||||||||||||||||||
| Disseminating Core | ||||||||||||||||||||
| Upload data | LONI BirnCC | |||||||||||||||||||
| Key Features | ||||||||||||||||||||
| Capturing work | ||||||||||||||||||||
| Integrate & QA | ||||||||||||||||||||
| DataSource Plugins | (Depends on Search Core) | |||||||||||||||||||
| GN | UT (Rob Williams) | |||||||||||||||||||
| Mediator | BirnCC (Jeff G) | |||||||||||||||||||
| BMDB/GENSAT keyword search plugins | LONI (Daren) | |||||||||||||||||||
| Spatial Registration Plugins | (Depends on Registration Core) | |||||||||||||||||||
| Landmark 2D Warping | CalTech (Davit) | |||||||||||||||||||
| Jibber | UCSD (Asif) | |||||||||||||||||||
| Viewer Plugins | (Depends on Viewer Core) | |||||||||||||||||||
| Large datasets | ||||||||||||||||||||
| Research approach | Duke (Jeff B) LONI (Daren) | |||||||||||||||||||
| Implement | Duke (Jeff B) LONI (Daren) | |||||||||||||||||||
| Image servers | ||||||||||||||||||||
| ArcIMS | UCSD (Asif) | |||||||||||||||||||
| NeuroTerrain | Drexel (Carl) | |||||||||||||||||||
| Analysis Plugins | (Depends on all Cores) | |||||||||||||||||||
| Correlation statistics | LONI (Daren) UT (Rob Williams) | |||||||||||||||||||
| Driving Biological Problem Plugins | ||||||||||||||||||||
| TBD | ||||||||||||||||||||